晋地方官制有郡、国二种，晋武帝灭吴以后，取得暂时统一，便改革秦、汉的旧制，重新分封五等爵士，与郡县制并行。其等级虽繁，但只有王、侯二级较为重要。王国以内史当郡守，侯国以相当县令，这与汉制相差不大。所不同的是，诸王多带刺史将军衔，典兵出镇；也有在中央任职，而本身并不出居所封之国。那些兼将军、刺史的，有长史、司马为其僚佐，事实上是代行其职权。南齐时又置典签，专在王之左右密切监视，权威反在刺史之上，称为签帅。因此，分封之爵士，仍属空名，不过在王侯之中又增添若干官吏而已。

　　晋封诸侯王国，分大、中、小三等，为重其兵权，大国置中军2，000人，上、下军各1，500人；次国上军2，000人，下军1，000人；小国又分三等：大国置守士100人，次国80人，小国60人。王国置师、友、文学各1人，改郡太守为内史，减省相及仆，有郎中令、中尉、大农，号称三卿。大国置左右常侍各1人，减郎中，置侍郎2人，典书、典祠、典卫、学官令、典书丞各1人，治书4人，中尉司马、世子庶子，陵庙牧长各1人。又有谒者4人、中大夫6人、舍人10人等，这些皆由国王自选文武官员充任。郡侯县公也如小国制度。公侯以下置官属，随国大小而异。

　　晋的地方官制也是州、郡、县三级制。州置刺史、别驾、治中从事（意谓居中治事、主众曹文书）、诸曹从事等员。又有主簿、门亭长、录事、记室书佐、诸曹佐、守从事、武猛从事等。共有吏员41人，卒20人。诸州边远，或有山险，临近寇贼羌夷的地方，又置弓马从事50余人，凉州、益州置吏85人，卒20人，徐州置淮海从事，凉州置河津从事，诸州置都水从事各1人，荆州又置监佃督1人。

　　郡皆置太守，河南郡为京师所在，特置河南尹。郡国户不满五千者，置职吏50人，散吏13人；五千户以上，置职吏63人，散吏21人；万户以上，职吏69人，散吏39人。此外，郡国不分大小，皆置文学掾一人。

　　郡下为县，大县置令，小县置长，下设主簿、录事史、主记室史、门下书佐、幹、游徼、议生、循行功曹史、小史、廷掾、功曹史、小史书佐幹、户曹掾史掾、法曹门幹、金仓贼曹掾史、兵曹史、吏曹史、狱小史、狱门亭长、都亭长、贼捕掾等员。户不满三百以下，职吏18人，散吏四人；户三百以上，职吏28人，散吏6人；户五百以上，职吏40人，散吏8人；户千以上，职吏53人，散吏12人；户千五百以上，职吏68人，散吏18人，户三千以上，职吏88人，散吏26人。每县均置方略吏4人，洛阳置六部尉，东晋以后建康也置六部尉，其余大县置2人，次县、小县各置1人。

　　县之下置乡，五百户以上置1乡，三千户以上置2乡，五千户以上置3乡，万户以上置4乡，每乡置啬夫1人。乡户不满千以下，置治书史1人；千以上置史、佐各1人，正1人；五千五百户以上，置史1人，佐2人。乡以下为里，百户置里吏1人，其地广人稀，听随宜置里吏，但不得少于五十户。千户以上置校官掾1人。

　　魏晋南北朝时期，由于南北分治及新开发地区增多之故，州的数目日多而辖境日狭。重要的军政长官往往兼督数州，或者此州之部分郡县而兼另一州之某些郡县，因此区域的划分不是经常固定的。由于战争的频繁，刺史、郡守之权极重，往往带将军称号。这种刺史，多开幕府，置僚属，形成地方政权。《通典·职官一四》说：

　　自魏晋以后，刺史多带将军“开府”，则州与府各置僚属，州官理民，府官理戎。

　　又《职官一五》说：

　　晋郡守皆加“将军”，无者为耻。

　　刺史任重者，则加以使持节都督某州或某某数州军事。凡不带军职的刺史，则称“单车刺史”。《通典。职官一四》说：

　　魏晋为刺史，任重者为使持节都督，轻者为使持节……

　　自魏以来，庶姓（非帝族）为州而无将军者，谓之单车刺史。

　　由于都督、刺史开府置僚属而造成地方政权机构繁杂，吏员无限增多的弊端。《晋书·傅玄传》载，咸宁初，傅玄之子傅咸上书晋武帝说：

　　旧都督有四，今并监军乃盈于十。夏禹敷土分为九州，今之刺史几向一倍。户口比汉十分之一，而置郡县更多。空校牙门，无益宿卫，而虚立军府，动有百数。五等诸侯，复坐置官属。……以为当今之急，先并官省事，静事息役，上下用心，唯农是务也。

　　傅咸当时已看出机构多、官属多的问题，要求晋武帝省官并事。西晋政府对这个问题也引起重视，曾经“议省郡县半吏以赴农功”，可是这件事却遭到中书监荀勖的反对，《晋书·荀勖传》载，荀勖对此事的看法是“省吏不如省官，省官不如省事，省事不如清心”。因而，省官并事，以劝农功之论未能付诸实施。由于机构多、官属多，自然造成许多一人兼数职而无从顾及。干宝《晋纪总论》说：

　　秉钧当轴之士，身兼官以数十，大极其尊，小录其要，机事之失，十恒八九。

　　象晋武帝时的王祥，既拜太保，又被“加置七官之职”。他做太保，本来就“萧然自放”，再加七个官职，这七官自然也更加“萧然自放了。”

　　机构多，官僚多，兼职多，表明了西晋这个封建国家是一部运转不灵的机器。干宝的《晋纪总论》在评论西晋官场风气时说：

　　进仕者以苟得为贵，而鄙居正；当官者以空望为高，而笑勤恪。……刘颂屡言治通，傅咸每纠邪正，皆谓之俗吏；其倚仗虚旷，依阿无心者，皆名重海内。……由是毁誉乱于善恶之实，情慝奔于货欲之涂。选者为人择官，官者为身择利。……悠悠风尘，皆奔竞之士，列官千百，无让贤之举。

　　这段话中肯地揭露了西晋官场的腐败作风。

　　西晋亡后，中原士族及其部曲相率南迁，东晋政权往往在南方各地设立侨州、侨郡、侨县以安置之。

　　南朝

　　刘宋地方官制，仿照两晋，行州、郡、县三级制。州设刺史一人，分领兵刺史（第四品）和不领兵刺史（等五品），下置别驾从事史，治中从事史，主簿，西曹书佐，祭酒从事史，议曹从事史、部郡从事史。自主簿而下，每州置多少人，无定制。别驾、西曹负责官吏及选举之事，治中主众曹文书之事，祭酒分掌诸曹兵、贼、仓、户、水诸事。扬州不设祭酒，而以主簿负责其事。

　　郡置太守1人，秩二千石；丞1人，秩六百石，下设功曹史，主选举；五官掾，主诸曹事。又有主犯史，主催督期会。又设上计掾、史各1人，每岁终向上条陈郡内众事，称为“阶簿”。

　　郡下设县，大县置令，小县置长1人、丞1人，大县置尉2人，小县1人。

　　县下置乡，乡的建制略如前代。

　　萧齐地方官制，也是州、郡、县三级，官员设置同刘宋。

　　萧梁地方官制，亦略同刘宋，州置刺史1人，二千石。别驾、治中从事各1人。又置主簿，西曹从事、议曹从事、祭酒从事、部传从事、文学从事，员额不等，各因其州之大小而定。

　　郡置太守、郡丞。郡为国则称内史。郡丞，三万户以上置佐1人。

　　郡下设县，县为封国者称相。大县为令，小县为长，皆置丞、尉。郡与县均置吏，员额均以郡县之大小而定。郡县吏中有书僮，武吏，医，迎新，送故等员，亦各因其郡县大小而置。

　　陈承梁制，地方官员之设置皆沿其旧制。

　　北朝

　　北魏地方官分州、郡、县三级。州长官分为州牧（从二品）、上州刺史（第三品）、中州刺史（从三品）、下州刺史（第四品）。天赐二年（公元405年），又诏诸州置三刺史（用六品者），宗室1人，异姓2人。

　　郡长官分上郡太守（第四品）、中郡太守（第五品）、下郡太守（第六品）。天赐二年（公元405年），诏诸郡置三太守（用七品者）。

　　县长官分上县令（第六品）、中县令（第七品）、下县令（第八品）。天赐二年（公元405年），又诏县置三令长（用八品者）。

　　州刺史、县令长各临其所任之州县，而太守上有刺史，下有令长，虽设置，但空有其名，未能实际治民。

　　北齐地方官制也是州、郡、县三级，但各分为九等。上上州刺史，置府。府属官有长史、司马、录事、功曹、仓曹、中兵等参军事及掾史、主簿、记室掾史、外兵、骑兵、长流、城局、刑狱等参军事及掾史，参军事及法、墨、田、铠、集、士等曹行参军及掾史，右户掾史，行参军，长兼行参军，督护，统府录事，统府直兵，箱录事等员；州属官，有别驾从事史，治中从事史，州都光迎主簿，主簿，西曹书佐，市令及史、祭酒从事史，部郡从事，皂服从事，典签及史，门下督，省事，都录事及史，箱录事及史、朝直、刺奸、记室掾、户曹、田曹、金曹、租曹、兵曹、左户等掾史等员。上上州府，州属官佐史，合393人。上中州减上上州10人。上下州减上中州10人。中上州减上下州51人。中中州减中上州10人。中下州减中中州10人。下上州减中下州50人。下中州减下上州10人。下下州减下中州10人。

　　上上郡置太守1人，属官有丞、中正、光迎功曹、光迎主簿、功曹、主簿、五官、省事、录事及西曹、户曹、金曹、租曹、兵曹、集曹等掾佐及太学博士，助教，太学生，市长，仓督等员。合属官佐史212人。上中郡减上上郡5人。上下郡减上中郡5人。中上都减上下郡45人。中中郡减中上郡5人。中下郡减中中郡5人。下上郡减中下郡40人。下中郡减下上郡2人。下下郡减下中郡2人。

　　上上县设令1人，属官有丞、中正、光迎功曹、光迎主簿、功曹、主簿、录事及西曹、户曹、金曹、租曹、兵曹等掾及市长等员。合属官佐史54人。上中县减上上县5人。上下县减上中县5人。中上县减上下县6人。中中县减中上县5人。中下县减中中县1人。下上县减中下县1人。下中县减下上县1人。下下县减下中县1人。

　　上、中、下诸镇，置镇将、副将、长史、录事参军、仓曹、中兵、长流、城局等参军事，铠曹行参军及市长、仓督等员。

　　上上州刺史，岁秩八百匹。上中、上下各以50匹为差。中上减上下100匹，中中及中下以50匹为差。下上减中下100匹，下中、下下亦各以50为差。

　　上上郡太守，岁秩500匹，上中、上下各以50为差。中上减上下40匹，中中及中下各以30匹为差。下上减中下40匹，下中、下下各以20匹为差。

　　上上县、岁秩150匹，上中、上下各以10匹为差，中上减上下30匹，中中及中下各以5匹为差。下上减中下20匹，下中、下下各以10匹为差。

　　州自长史已下，及于史吏；郡县自丞已下，及于掾佐，亦皆以帛为秩。若郡设尉，则尉秩减丞一半。

　　北齐官员，既定品级（共九品，有从、正），又定禄秩，如官正一品，每岁禄700匹，200匹为一秩；从一品700匹，175匹为一秩；二品，岁禄600匹，150匹为一秩；从二品，岁秩500匹，125匹为一秩。降至九品，岁禄28匹，7匹为一秩；从九品24匹，6匹为一秩。官吏的禄率以三分：一分以帛，一分以粟，一分以钱。若政事繁忙时优待一秩，平时守本秩，闲时降一秩。凡官吏不办事，不朝拜者，皆不给禄。

　　北周亦行州、郡、县三级地方制。但均以户之多少确定州、郡、县命官的高下。雍州置州牧，其他置刺史，户三万以上为正八命州，二万以上为八命州，一万以上为正七命州，五千以上为七命州，户不满五千以上为正六命州，共五等。每州属官有长史、司马、司录、大呼药、小呼药、别驾、治中主簿、列曹参军等。

　　郡除京兆置尹外，其他均置太守，亦以户数为别。户一万五千以上为七命郡，户一万以上为正六命郡，户五千以上为六命郡，户一千以上为正五命郡，户不满一千以上为五命郡，共五等。每郡置郡丞、主簿。

　　县置令，亦以户数为别。户七千以上为五命县，户四千以上为正四命县，户二千以上为四命县，户五百以上为正三命县，不满五百以下为三命县，共五等。每县属官有县丞、主簿、博士等。